Aliases et liste situations (private - contact us if you need to access)
3 fichiers contenant des listes d'aliases des gènes contenus dans SQUAT pour les 3 espèces (homme, souris, poulet) 2 fichiers contenant les listes des situations contenues dans SQUAT pour l'homme et la souris.
Promoteurs fasta (private - contact us if you need to access)
Quelques régions promotrices au format fasta pour interroger Transfac en ligne
Corpus and tools for NER pb (private - contact us if you need to access)
Some different tagged data sets for recognition of gene names. This directory also contains some script to transform text to dmt4format and vice versa
BioCreative Corpuses for Protein/Protein Interaction (private - contact us if you need to access)
Le workshop Biocreative 2006 propose 4 sous-tâches : * Interaction Article subtask (IAS): classer et rank des résumés de pubmed en fonction de leur pertinence pour l'annotation d'intéraction de proteines. * Interaction pair subtask (IPS): extraction d'intéractions binaires P/P à partir d'articles complets (pas le résumé) où les protéines sont annotées avec leur identifiant SwissProt. * Interaction method subtask (IMS): "extraction of the interaction detection method used to characterize the protein interactions described in the paper". Doivent être caractérisées avec des MI ontology ID. * interaction sentence subtask (ISS): retrouver les passages qui décrivent/résument l'intéraction.
Other Ressources for Interactions (private - contact us if you need to access)
